武汉市妇女儿童医疗保健中心于2003年9月成立，由武汉市儿童医院和武汉市妇幼保健院组成。武汉市儿童医院和武汉市妇幼保健院分别始建于1954年和1992年。中心担负着全省及邻近地区儿童疾病的医疗、科研任务和武汉市近500万妇女儿童的卫生保健及其管理、指导任务。
中心占地面积共6.55万平方米，拥有三个门诊部和一幢10层、二幢3层共600张病床的现代化病房大楼。中心还将在近年内兴建1.6万平方米的妇幼保健大楼和2万平方米的外科综合大楼。病区内设中央空调、中心负压吸引、中心供氧系统，建有ICU、NICU、CCU等重症监护单元和急救网络系统。中心在编职工1144人，其中具有高级职称人员193人；是武汉大学、华中科技大学同济医学院、河南新乡医学院的教学基地，有兼职教授35人，每年担负着本科、大专、中专及进修计1000余名医学生的临床教学和实习任务；中心还设有武汉市卫生学校分校，为儿科护理培养专门人才。
中心专科设置齐全，有小儿内、外、眼、耳鼻咽喉、皮肤、急救、中西医结合、中医、外科日间手术、妇产科等临床科室及儿童保健科、妇女保健科、基层指导科等预防保健科室，设有药剂、检验、放射、超声、内窥镜等十余个医技科室。配备有全身螺旋CT、核磁共振、1250毫安X光机、数字成影血管造影机、人工呼吸机、全自动生化分析仪、全自动细菌培养系统、动态脑电图、高压氧舱等大、中型医疗仪器。
中心着力发展重点专（学）科，小儿心胸外科、生殖健康科为市级重点专（学）科，小儿耳鼻咽喉科、小儿神经内科、小儿腹腔镜专科、小儿CT与MRI影像诊断科、医学分子生物学与免疫学是市级重点专（学）科建设单位。1999年经湖北省卫生厅批准，“湖北省儿童心血管疾病诊疗中心”在市儿童医院成立。中心还建立了小儿气管异物治疗中心、小儿哮喘病诊疗中心、小儿日间手术治疗中心、小儿肾病治疗中心、小儿微创及腹腔镜外科诊疗中心。投入了一定的人力物力，为发展专科专病优势创造条件，使其治疗水平进一步提高。
市妇幼保健院在全市建立了辐射13个区1028个社区的三级妇幼保健服务网络和妇女儿童疾病监测网络，在全国率先开展了婚检人群艾滋病筛查，并在全市广泛开展了新生儿疾病筛查，产前唐氏综合症筛查工作，为提高全市出生人口素质，提高妇女儿童生存质量做了卓有成效的工作。