以研究为主的硕士学位其研习期间至少需时二年，博士学位为期至少三年。换言之，至少需要在学校注册三年，始能提交论文。若系原以硕士为目标，而後攻读博士学位者，其硕士学位研习期间往往亦可合并计算。另外，凡攻读硕士学位者，如指导教授认为满意，可在修习硕士一年後，申请转入博士学位之研究，其第一年之修业期间可合计於博士修业年资中。至於其以研究为主的学位名称，较常见的为M. Phil及 Ph. D.（或称 D. Phil） ，牛津大学的研究硕士称为M. Litt. (Master of Letters)。至於 Doctor of Letters (D. Litt.)以及 Doctor of Science（ＤＳｃ）两种博士学位，通常是颁授给在各科领域中有极杰出贡献者，属於高级博士学位（Senior Doctorates）的一种，亦有时带有荣誉学位的性质。
牛津大学各学院学生总数有一万二千人左右，其中九千名左右是大学部学生，而教职员共有五千四百人。大学中的主要行政人员，均选自牛津本身的教授及研究员。校长(Chanceller)是一项名誉职，而实际行政工作，由校长主持。
校长由各学院轮流产生，任期四年。由所有的牛津毕业生组成的大学评议会(Convocation），负责选出每任校长。而实际的行政监督、建议工作，则由教职员大会(Congregation)所负责。大会选出十八名执行委员（Hebdomadal Council），每周开会乙次，会同校中行政人员，决定学校发展方向。
大学中的训导长也由各学院轮流选出。担任训导长的额外报酬，是可以在任期内，获赠牛津大学出版部的所有出版书籍，而在他们的学位袍上，亦可终身加配一条黑色的肩带，以表学校对其工作的感谢。另外大学中的校警，被学生昵称为「牛头犬」（Bulldog）。他们执行工作时，仍头戴传统的大礼帽，颇有古风，校警向大学的训导长负责。
目前牛津大学有四分之三的经费，来自英国政府。而其馀财务所需，则得自於各学院及募捐。经常各学院依其财务实际负担及赤字状况，要求学生分摊，其金额往往高达一、二千英镑。学校的财务部门，称之为大学之匣(University Chest)，因为早期的大学帐房，都把金钱存放在一只小铁匣内。直到现在，大学的行政中心威灵顿广场（Williamton Square），仍保留有一只象徵意义的小铁匣。而学生缴费只要依学院所开列数额，开一张支票放於杜鹃窝（Pigeon hole)内，而不必到财务会计部门缴纳，相当方便。